在Debian上管理MongoDB的磁盘空间可以通过以下几个步骤进行：

删除不必要的数据：

删除集合：使用 db.collection.drop() 命令删除不再需要的集合。删除文档：使用 db.collection.remove() 命令删除不再需要的文档。删除数据库：使用 db.dropDatabase() 命令删除整个数据库。

使用压缩：

启用压缩引擎：MongoDB 3.0及以上版本支持使用压缩引擎来减少磁盘空间占用。可以在启动MongoDB时使用 --storageEngine 参数指定使用的压缩引擎，例如 --storageEngine wiredTiger。执行compact命令：使用 db.runCommand({ compact: 'collection_name' }) 对集合进行压缩，释放未使用的空间。

数据库维护操作：

repairDatabase：使用 db.runCommand({ repairDatabase: 1 }) 命令修复数据库，可以回收磁盘空间。注意，该命令会花费较长时间并可能影响性能，应谨慎使用。

磁盘碎片整理：

compact命令：使用 compact 命令对数据库进行压缩和碎片整理，释放未使用的空间。重建集合：将数据从一个集合复制到一个新的集合中，消除碎片并重新组织数据。

备份和恢复：

使用 mongodump 备份整个数据库，然后使用 mongorestore 将备份文件还原到一个新的数据库，从而减少磁盘空间的使用。

清理日志文件：

清理和归档MongoDB生成的日志文件，以减少存储空间的使用。

监控和调整：

定期监控数据库的存储空间使用情况，根据实际情况进行调整。

配置数据存储引擎：

MongoDB支持多种存储引擎，如WiredTiger 和In-Memory。确保使用适合工作负载的存储引擎，以优化空间使用和性能。

启用日志压缩：

对于使用WiredTiger存储引擎的MongoDB实例，可以启用日志压缩功能，以减少日志文件占用的空间。

使用MongoDB Profiler：

通过MongoDB Profiler记录耗时操作，帮助识别和优化可能导致空间使用增加的操作。

定期维护：

包括清理无用的索引、删除过期的数据集等，以减少数据库的存储压力。

通过上述方法，可以有效地管理MongoDB在Debian上的磁盘空间，确保数据库的高效运行和数据的长期保存。