要优化Ubuntu上的MySQL查询速度，可以采取以下措施：

优化查询语句：

使用EXPLAIN分析查询语句，了解其执行计划。避免使用SELECT *，只选择需要的列。使用JOIN代替子查询，当可能的时候。使用索引来加速查询。

优化索引：

确保对经常用于搜索条件的列创建索引。使用复合索引来覆盖多个列的查询。定期分析和优化索引，使用ANALYZE TABLE和OPTIMIZE TABLE命令。

配置MySQL：

调整my.cnf或my.ini文件中的配置参数，如innodb_buffer_pool_size、max_connections、query_cache_size等。根据服务器的内存大小调整缓冲区和缓存的大小。

硬件优化：

增加内存，特别是增加InnoDB缓冲池的大小。使用更快的存储设备，如SSD。确保有足够的CPU资源。

数据库结构优化：

正规化数据库以减少数据冗余。对于非常大的表，考虑分区。

使用缓存：

利用MySQL的查询缓存功能（如果适用）。使用外部缓存系统，如Redis或Memcached。

定期维护：

定期备份数据库。定期清理旧数据和不必要的索引。监控数据库性能，及时发现问题。

升级MySQL版本：

如果可能，升级到MySQL的最新稳定版本，以利用最新的性能优化和bug修复。

使用慢查询日志：

启用慢查询日志来记录执行时间超过设定阈值的查询。分析慢查询日志，找出并优化这些查询。

分布式和读写分离：

对于高负载的应用，考虑使用主从复制实现读写分离。对于非常大的数据集，可以考虑使用分布式数据库系统。

在实施任何优化措施之前，建议先在测试环境中进行测试，以确保优化措施不会对应用程序产生负面影响。此外，优化是一个持续的过程，需要定期评估和调整。