备份Debian上的MongoDB数据库可以通过mongodump工具来完成。以下是备份MongoDB数据库的步骤：

登录到服务器：使用SSH登录到你的Debian服务器。

创建备份目录：创建一个目录来存放备份文件，例如：

mkdir -p /backup/mongodb

使用mongodump进行备份：mongodump是MongoDB自带的备份工具，可以用来导出数据库的内容。以下是一个基本的mongodump命令示例：

mongodump --out /backup/mongodb/$(date +%Y%m%d%H%M%S)

这个命令会在/backup/mongodb/目录下创建一个以当前日期和时间命名的子目录，并将备份文件存储在这个子目录中。

如果你需要指定数据库进行备份，可以使用--db选项：

mongodump --db your_database_name --out /backup/mongodb/$(date +%Y%m%d%H%M%S)

如果MongoDB运行在非默认端口或者需要认证，你可能需要添加额外的选项，例如：

mongodump --host your_host --port your_port --username your_username --password your_password --authenticationDatabase admin --db your_database_name --out /backup/mongodb/$(date +%Y%m%d%H%M%S)

压缩备份文件（可选）：为了节省空间，你可以压缩备份文件：

tar czvf /backup/mongodb/$(date +%Y%m%d%H%M%S).tar.gz /backup/mongodb/$(date +%Y%m%d%H%M%S)

这将创建一个.tar.gz格式的压缩文件。

验证备份（可选）：你可以使用mongorestore工具来验证备份文件的完整性：

mongorestore --drop /backup/mongodb/$(date +%Y%m%d%H%M%S)/your_database_name

如果mongorestore成功执行并且没有错误，那么你的备份很可能是完整的。

自动化备份（可选）：如果你想自动化备份过程，可以将上述命令添加到cron作业中。编辑crontab文件：

crontab -e

然后添加一行来设置备份计划，例如每天凌晨2点执行备份：

0 2 * * * /usr/bin/mongodump --out /backup/mongodb/$(date +%Y%m%d%H%M%S)

请确保在执行备份操作之前，MongoDB服务正在运行，并且你有足够的权限来访问数据库和备份目录。此外，根据你的实际需求调整命令中的选项和参数。