在Linux系统中，排查MySQL故障可以采用以下方法：

查看错误日志：

MySQL的错误日志通常位于/var/log/mysql/error.log。通过查看这个文件，可以获取到MySQL启动、运行和关闭过程中的详细信息，以及可能出现的错误消息。

使用mysqladmin工具：

mysqladmin是一个用于管理MySQL服务器的命令行工具。你可以使用它来检查服务器的状态、关闭或重启服务器、查看进程列表等。例如，运行mysqladmin status可以查看服务器的当前状态。

检查系统资源：

使用top、htop、vmstat等命令检查系统的CPU、内存、磁盘I/O等资源使用情况。如果资源不足，可能会导致MySQL性能下降或出现故障。

分析慢查询日志：

如果启用了慢查询日志，可以通过分析慢查询日志来找出执行缓慢的SQL语句，这些语句可能是导致性能问题的原因。

使用EXPLAIN分析查询：

对于特定的查询，可以使用EXPLAIN关键字来查看MySQL是如何执行这个查询的。这有助于识别查询中的性能瓶颈。

检查配置文件：

MySQL的配置文件（通常是my.cnf或my.ini）包含了服务器的各种设置。检查这些设置是否正确，以及是否有不兼容的配置项。

使用诊断工具：

MySQL提供了一些内置的诊断工具，如mysqlcheck、mysqldumpslow等，可以帮助你检查和修复数据库问题。

查看进程列表：

使用SHOW PROCESSLIST;命令可以查看当前连接到MySQL服务器的所有客户端及其执行的查询。这有助于识别长时间运行的查询或死锁。

检查网络连接：

确保MySQL服务器的网络连接正常，没有防火墙或其他网络设备阻止连接。

升级和打补丁：

如果你使用的是较旧的MySQL版本，考虑升级到最新版本以获取最新的安全补丁和性能改进。

在进行故障排查时，建议按照一定的顺序进行，从最简单的方法开始，逐步深入。同时，记录下你的操作和发现的信息，以便在需要时进行回顾和分析。