Hive聚合函数在SQL中的限制主要包括以下几点：

聚合函数的使用受到数据类型的限制。例如，如果使用AVG函数，那么参与计算的数据类型必须是数值型，包括TINYINT、SMALLINT、INT、BIGINT、FLOAT、DOUBLE和DECIMAL等。对于字符串类型的数据，Hive会抛出错误。在使用聚合函数时，必须使用GROUP BY语句对结果集进行分组。这是因为聚合函数会对每个分组进行计算，而不是对整个数据集进行计算。如果没有使用GROUP BY语句，那么Hive会抛出一个错误。Hive不支持使用HAVING子句来过滤聚合后的结果。HAVING子句通常与GROUP BY子句一起使用，用于对聚合后的结果进行过滤。然而，Hive并不支持这种用法，而是提供了WHERE子句来过滤数据。如果需要在聚合后对结果进行过滤，可以先使用GROUP BY子句对数据进行分组，然后在外层查询中使用WHERE子句对分组后的结果进行过滤。Hive中的聚合函数不支持使用多个列进行计算。例如，AVG(column1, column2)这样的表达式是不被允许的。如果需要对多个列进行计算，可以将这些列转换为同一类型，然后使用单个聚合函数进行计算。Hive中的聚合函数不支持使用嵌套的聚合函数。例如，AVG(AVG(column))这样的表达式是不被允许的。如果需要使用嵌套的聚合函数，可以先使用一个聚合函数对数据进行计算，然后将结果作为另一个聚合函数的输入进行计算。Hive中的聚合函数在处理大数据集时可能会遇到性能问题。由于Hive是基于Hadoop构建的，因此其性能受到Hadoop集群的性能限制。当处理大数据集时，可能需要考虑使用其他更高效的计算引擎，如Spark等。

请注意，以上限制可能会因Hive的版本和配置而有所不同。在实际使用中，建议参考Hive的官方文档以获取最准确的信息。