SQL Server在Debian上运行存在一些限制和挑战，主要包括以下几点：

官方支持有限：Microsoft SQL Server官方主要支持Red Hat、SUSE、Ubuntu等Linux发行版，对于Debian的支持相对较少。这意味着在Debian上使用SQL Server可能会错过一些官方提供的优化、更新和故障排除资源。

安装过程复杂：要在Debian上安装SQL Server，用户需要手动添加Microsoft的GPG密钥和存储库，然后通过APT包管理器进行安装。这增加了安装过程的复杂性。

依赖性问题：在安装SQL Server时，可能会遇到依赖性问题，例如无法安装某些必要的库（如libldap-2.4-2）。这可能需要手动解决依赖关系，增加了安装和配置的复杂性。

性能优化限制：虽然可以在Debian上安装和运行SQL Server，但可能无法享受到与官方支持的Linux发行版相同的性能优化。这可能会影响到数据库的响应速度和整体性能。

功能支持不完整：某些SQL Server的高级功能可能在Debian上无法使用或支持不完全。这可能会限制开发者在使用这些功能时的灵活性和效率。

社区支持有限：与Ubuntu等流行发行版相比，Debian上的SQL Server社区支持可能较少。这可能会使得在遇到问题时，寻找解决方案和帮助变得更加困难。

安全性：虽然Debian开源操作系统拥有活跃的开源社区和严格的用户权限管理，这有助于提高系统的安全性，但在配置SQL Server时，仍需采取一系列的安全措施，如更新系统和软件、使用最小特权原则、配置防火墙、启用日志记录功能等。

备份和恢复：在Debian系统上直接备份SQL Server数据库并不是一个常见的做法，因为SQL Server通常与Windows操作系统一起使用。然而，如果需要在Debian上备份数据，可以考虑使用SQL Server Management Studio (SSMS)、备份软件或手动备份数据库文件等方法。

网络配置：在Debian系统上配置SQL Server的网络连接，需要安装SQL Server、配置SQL Server网络配置、配置防火墙以及配置SQL Server允许远程连接。

总之，虽然SQL Server可以在Debian上运行，但用户在安装、配置、性能优化以及安全性方面可能会遇到一些挑战。