要实现一个简单的PHP文件管理系统，可以按照以下步骤进行：

创建数据库：首先需要创建一个数据库来存储文件信息，包括文件名、文件路径、文件大小等数据。

创建文件上传页面：创建一个简单的文件上传页面，让用户可以通过表单上传文件。

处理文件上传：在文件上传页面中，编写PHP代码来处理文件上传操作，包括接收上传的文件、将文件保存到服务器指定的目录中，并将文件信息插入数据库中。

创建文件列表页面：创建一个文件列表页面，用来显示服务器上已经上传的文件列表，可以显示文件名、文件大小、上传时间等信息。

实现文件下载功能：在文件列表页面中，为每个文件添加下载链接，让用户可以点击下载文件。

实现文件删除功能：为每个文件添加删除按钮，让用户可以删除文件。

实现文件搜索功能：添加文件搜索功能，让用户可以根据文件名或文件大小等条件进行搜索。

添加文件权限功能：根据需要，可以添加文件权限功能，限制用户对文件的访问和操作权限。

通过以上步骤，就可以实现一个简单的PHP文件管理系统。当然，根据实际需求和复杂程度，还可以进一步扩展和优化功能。