淘宝官方旗舰店和专卖店的区别主要是两者的属性、要求、类型、责任主体不同。正常情况下，淘宝官方旗舰店和专卖店商品的货源一般都是同厂同源的，消费者可以根据自己的购物需求选择店铺购买。

1、属性

淘宝官方旗舰店是品牌主体，也就是品牌自己在上架售卖商品；专卖店是得到品牌主体的授权代理，可以在专卖店只售卖该品牌的商品。

2、要求

淘宝官方旗舰店是品牌拥有人才能开的店铺；而专卖店是要得到品牌拥有人授权才能开专卖店，相当于一级经销商或分销商。

3、类型

旗舰店是官方的，专卖店是官方授权的。

4、责任

旗舰店要对品牌或公司负责，而专卖店要对品牌负责。

总的来说，淘宝官方旗舰店就是品牌的所有者开设的店铺，而专卖店是得到品牌的授权，店铺只能经营售卖该品牌的商品。