如果在启动Hadoop集群时发现jps命令输出中缺少secondary进程，可能是由于Secondary NameNode未启动或者启动失败导致的。在这种情况下，可以尝试以下步骤解决问题：

检查Secondary NameNode的日志文件，查看是否有任何错误信息。通常日志文件位于Hadoop安装目录下的logs目录中。

尝试手动启动Secondary NameNode服务。可以通过执行以下命令启动Secondary NameNode：

hadoop-daemon.sh start secondarynamenode

检查Hadoop配置文件中是否正确配置了Secondary NameNode的相关参数。可以在hdfs-site.xml文件中查找相关配置项，并确保配置正确。

如果以上步骤都无法解决问题，可以尝试重新启动Hadoop集群，或者检查网络连接是否正常。有时网络故障也可能导致Secondary NameNode无法正常启动。

如果以上方法均无效，建议查看Hadoop官方文档或者寻求专业人士帮助解决问题。