在Linux系统中，Node.js应用的日志存储位置取决于多种因素，包括进程管理器、自定义配置和系统架构。以下是一些常见情况和建议：

使用进程管理器（如PM2）：

默认情况下，PM2会将日志文件存储在用户主目录下的.pm2/logs文件夹中。例如，如果你的应用名为myapp，则日志文件通常位于~/.pm2/logs/myapp-err.log和~/.pm2/logs/myapp-out.log。

自定义日志目录：

开发者可以在应用代码中使用日志库（如Winston、Log4js）并指定自定义日志目录。这允许更灵活地管理日志文件，例如根据应用模块或环境分别存储日志。

系统日志目录(/var/log)：

虽然/var/log是系统日志的标准位置，但通常不建议将Node.js应用日志直接写入此处，以免与系统日志混淆，增加管理难度。不过，你可以为应用创建子目录，如/var/log/your_node_app，并确保Node进程有写入权限。

日志聚合系统：

对于大型应用或需要集中监控日志的情况，建议使用ELK Stack（Elasticsearch, Logstash, Kibana）或其他日志聚合系统，将日志集中存储和分析。

日志轮转：

使用工具如logrotate来管理日志文件的大小和数量，避免单个日志文件过大。

安全性：

根据日志内容的敏感程度，采取相应的安全措施，例如访问控制和加密。

通过合理规划日志存储位置，可以显著降低运维复杂度并提升故障排查效率。