防止日本服务器被恶意攻击的方法：1、选择比较知名的服务商；2、做好软件安全设置。

1、选择比较知名的服务商

在租用服务器的时候建议选择专业的日本机房服务商，不仅能够确保硬件和网络的可靠性，而且有实力的少数日本机房还大规模采用SDN网络架构，网络冗余充足即使遇到恶意的流量攻击也能在一定程度上进行防御。

2、做好软件安全设置

在租用日本服务器搭建网站的时候，软件和系统安全设置也很重要，所以在服务器交付之后应该及时进行安全测试，更改登陆端口和密码并安装合适安全杀毒软件和软件防火墙，当然像这样的专业日本机房服务商也提供相关的资讯服务，24小时免费，充分确保用户的服务器安全