搭建日本VPS服务器有以下几个步骤：

1.选择VPS提供商：在市场上选择一个可靠的VPS提供商。

2.选择服务器配置：根据你的需求选择服务器配置，包括CPU、内存、存储空间和带宽等。

3.选择服务器的地理位置：在日本选择一个服务器位置，以确保服务器的延迟较低。

4.注册账号并购买VPS：在VPS提供商的网站上注册账号并购买所需的VPS服务器。

5.设置SSH访问：通过SSH访问服务器，可以使用工具如PuTTY或者OpenSSH。

6.安装操作系统：在服务器上安装你选择的操作系统，通常可以选择Ubuntu、CentOS等。

7.配置服务器：根据你的需求配置服务器，包括安装所需的软件、设置防火墙、开通端口等。

8.设置域名和DNS：如果你有自己的域名，可以将它解析到你的服务器上，并配置DNS设置。

9.测试服务器：通过访问服务器的IP地址或域名，确保服务器能够正常工作。

10.备份和监控：定期备份服务器数据，并设置监控系统以确保服务器的稳定性和安全性。

以上是大致的搭建日本VPS服务器的步骤，具体操作可能会因为VPS提供商和操作系统的不同而有所差异。建议在操作前先了解相关文档或咨询VPS提供商的技术支持。