国内服务器备案的缺点包括：

时间消耗：备案需要提交大量资料，审核时间较长，可能需要数周或数月才能完成备案流程，影响网站上线和业务正常运行。

管理繁琐：备案后需要定期更新备案信息，如网站内容、负责人信息等，需要保持备案信息的完整和准确性。

限制网站内容：备案制度要求网站内容必须符合相关法规和规定，不能含有违法、危害社会公共利益等内容，有一定的限制。

地域限制：备案信息需与服务提供商所在地相符，对于跨地域运营的企业可能存在一定的困难。

安全隐患：备案信息涉及个人身份信息和企业资料，存在被泄露或滥用的潜在风险。

成本较高：备案需要支付一定的费用，包括备案申请费、年审费等，增加了网站运营的成本。