在使用日本服务器搭建视频网站时，需要注意以下几个问题：

版权问题：确保视频网站上的所有内容都具有合法的版权。如果使用未经授权的视频或音频内容，可能会面临法律诉讼和侵权行为。

用户隐私保护：遵守日本的个人信息保护法规，确保用户的个人信息不被泄露或滥用。

网络安全：加强服务器的安全性，保护网站免受黑客攻击和其他网络安全威胁。

稳定性和速度：确保服务器能够提供稳定的服务和快速的加载速度，以提供良好的用户体验。

地理位置：考虑到服务器的地理位置对网站访问速度的影响，尽量选择距离用户较近的服务器位置。

合规性：遵守日本的网络监管法规，如反恐怖主义法、网络安全法等，确保网站运营合法合规。

总的来说，搭建视频网站需要综合考虑内容、用户、安全、稳定性等多方面因素，以确保网站的顺利运营和用户体验。