要使用Prometheus进行监控数据的收集和存储，需要按照以下步骤进行操作：

安装Prometheus：首先需要在服务器上安装Prometheus。可以从Prometheus的官方网站下载二进制文件，或者通过包管理工具安装Prometheus。

配置Prometheus：在安装完成后，需要配置Prometheus以定义要监控的目标和规则。可以编辑Prometheus的配置文件prometheus.yml来添加监控目标的信息，如要监控的服务器地址、端口等。

启动Prometheus服务：配置完成后，启动Prometheus服务，让其开始收集监控数据。可以通过命令行启动Prometheus，也可以将Prometheus设置为系统服务进行自动启动。

配置监控目标：为了让Prometheus收集监控数据，需要在要监控的应用中添加Prometheus的客户端库，并在应用中定义需要监控的指标。

可视化监控数据：Prometheus自带一个基本的监控数据可视化工具Prometheus GUI，可以通过浏览器访问Prometheus GUI来查看监控数据的图表和报告。

存储监控数据：Prometheus默认使用本地存储来存储监控数据，但也可以配置Prometheus与其他存储系统集成，如Grafana、InfluxDB等。

通过以上步骤，就可以使用Prometheus进行监控数据的收集和存储，实现对系统性能和运行状态的实时监控和分析。