MongoDB初始化副本集的方法如下：

启动MongoDB实例：首先启动一个MongoDB实例，作为副本集的主节点(primary)。

创建配置文件：在主节点上创建一个配置文件，包含副本集的配置信息，如副本集的名称、主节点的IP地址和端口号以及其他副本节点的IP地址和端口号。

启动副本节点：在其他服务器上启动MongoDB实例，作为副本集的副本节点(secondary)。

添加副本节点：在主节点上使用Mongo shell或MongoDB驱动程序的add方法，将副本节点添加到副本集中。

验证副本集状态：使用Mongo shell的rs.status()命令验证副本集的状态，确保所有节点都已成功加入副本集。

设置优先级：如果需要指定主节点或副本节点，可以使用Mongo shell的rs.reconfig()命令设置节点的优先级。

设置读写关注点：可以使用Mongo shell的rs.slaveOk()命令设置副本节点的读写关注点。

监控副本集：使用Mongo shell的rs.printReplicationInfo()命令监控副本集的复制状态和延迟情况。

通过以上步骤，可以成功初始化一个MongoDB副本集。