管理云虚拟主机上的数据库可以通过以下几种方式进行：

使用命令行工具：可以通过SSH登录到服务器，并使用命令行工具（如MySQL命令行客户端）来管理数据库。可以执行创建、删除、修改、查询等操作。

使用图形化界面工具：可以使用图形化界面的数据库管理工具（如phpMyAdmin、Navicat等）连接到数据库，并通过可视化界面进行管理操作。这些工具通常可以提供更直观的操作界面和更方便的管理功能。

使用Web控制台：一些云服务提供商会提供Web控制台，用户可以登录到控制台，通过界面进行数据库管理操作。这种方式通常适用于云服务商提供的托管数据库服务。

无论使用哪种方式，管理数据库的基本操作包括创建数据库、创建数据表、插入、查询、修改和删除数据等。具体操作步骤可以根据不同的工具和数据库类型进行调整。