要清空虚拟主机数据库的数据，可以按照以下步骤进行操作：

登录到虚拟主机的控制面板或使用FTP客户端登录到主机服务器。

找到数据库管理工具，通常是phpMyAdmin或类似的应用程序。

在数据库管理工具中，选择要清空的数据库。

在数据库中选择所有的表格。

选择“操作”或类似的选项，然后选择“清空”或“删除”。

确认清空操作，通常会要求再次确认。

等待操作完成，这可能需要一些时间，具体取决于数据库的大小和服务器的性能。

清空完成后，可以通过插入新数据或从备份中恢复数据来重新填充数据库。

请注意，在清空数据库之前，一定要确保已经备份了重要的数据，以免意外丢失。