云主机系统设置的方法包括以下几种：

控制面板设置：云服务提供商通常会提供控制面板，用户可以通过控制面板进行系统设置，如安装操作系统、调整网络设置、配置防火墙、设置安全策略等。

远程桌面连接：用户可以通过远程桌面连接到云主机，然后进行系统设置。远程桌面连接可以使用Windows自带的远程桌面连接工具或第三方工具，如PuTTY、Xshell等。

命令行界面：用户可以通过命令行界面（如Windows的命令提示符、Linux的终端）进行系统设置。通过命令行界面可以使用各种命令进行系统配置，如修改配置文件、安装软件、设置用户权限等。

API接口：云服务提供商通常会提供API接口，用户可以通过调用API接口进行系统设置。API接口可以通过编程语言（如Python、Java）来调用，实现自动化的系统设置。

需要注意的是，不同的云服务提供商可能会有不同的系统设置方法，用户需要根据具体的云主机服务提供商进行操作。