关闭 VPS 上的端口有多种方法，以下是其中几种常见的方法：

使用防火墙：可以使用防火墙软件（如iptables）来关闭 VPS 上的端口。通过配置防火墙规则，可以禁止外部访问指定的端口。例如，可以使用以下命令关闭端口 80：

sudo iptables -A INPUT -p tcp --dport 80 -j DROP

修改服务配置文件：如果要关闭某个特定服务的端口，可以修改该服务的配置文件。例如，如果要关闭 Apache 的默认端口 80，可以编辑 Apache 的配置文件（如/etc/httpd/conf/httpd.conf）并将监听端口改为其他端口或注释掉相应的配置行。

禁用服务：可以通过停止或禁用相关服务来关闭端口。例如，如果要关闭 SSH 端口（默认为 22），可以使用以下命令停止 SSH 服务：

sudo service ssh stop

请注意，在进行任何更改之前，建议备份相关配置文件以防止意外情况发生。此外，关闭某些端口可能会影响某些服务或应用程序的正常运行，请确保在关闭端口之前了解其影响。