管理虚拟主机的方法有以下几种：

1. 控制面板：使用控制面板可以方便地管理虚拟主机，包括创建、删除、修改网站、设置域名、数据库、邮件账号等。

2. 命令行工具：通过命令行工具，可以执行一些高级操作，如创建、删除、修改虚拟主机、配置文件、安装软件等。

3. FTP：通过FTP客户端可以上传、下载文件，管理网站的文件和目录。

4. SSH：通过SSH远程登录服务器，可以执行命令、修改配置文件、安装软件等。

5. 文件管理器：通过文件管理器可以直接在服务器上管理文件和目录，如上传、下载、删除、复制、移动文件等。

6. 数据库管理工具：通过数据库管理工具可以管理数据库，包括创建、删除、修改表结构、导入导出数据等。

7. 日志分析工具：通过日志分析工具可以监控和分析网站的访问日志，了解网站的流量、访问情况等。

8. 监控工具：通过监控工具可以监控服务器的性能、资源使用情况，提前发现并解决问题。

需要根据具体的虚拟主机提供商和操作系统来选择适合的管理方法。