在MongoDB中，有两种方法可以合并两个集合或两个数据库的数据：

使用$lookup操作符进行关联查询：$lookup操作符可以在一个集合中查找与另一个集合匹配的文档，并将匹配的文档合并到结果中。这个操作可以用来合并两个集合的数据。例如，可以在一个集合中查找与另一个集合中的文档关联的文档，然后将它们合并到一个新的集合中。

使用$merge操作符进行合并：$merge操作符可以将一个集合的数据合并到另一个集合中。这个操作可以用来合并两个集合的数据。例如，可以将一个集合的数据合并到另一个集合中，或者将两个集合的数据合并到一个新的集合中。使用$merge操作符时，需要指定目标集合的名称和合并的条件。

需要注意的是，以上两种方法都是在查询时进行数据合并，不会改变原始集合的数据。如果需要永久合并两个集合或两个数据库的数据，可以考虑使用ETL工具或编写自定义脚本来实现。