VPS备份数据的方式有以下几种：

手动备份：手动将数据复制到另一个存储介质，例如外部硬盘或云存储服务中。这种方式需要用户自己定期进行备份操作。

自动备份：通过设置定时任务或使用备份软件，自动将数据备份到指定的存储介质中。用户可以根据需求设置备份频率和存储位置。

快照备份：VPS提供商通常会提供快照功能，可以创建VPS系统的快照，包括操作系统、应用程序和数据等。快照备份是一种快速且完整的备份方式。

数据库备份：对于使用数据库的应用程序，可以使用数据库自带的备份工具或第三方备份工具，将数据库的数据进行备份。

增量备份：在完整备份的基础上，只备份新增或修改的数据，以减少备份的时间和存储空间。增量备份需要依赖备份软件或脚本来实现。

无论选择哪种备份方式，都建议将备份数据存储在不同的地理位置，以防止数据丢失或灾害发生时能够恢复数据。