VPS服务器被黑的原因可能有以下几种：

弱密码：使用弱密码或者常见密码容易被黑客破解，进而入侵服务器。

未及时更新系统和软件：服务器系统和软件存在漏洞时，黑客可利用这些漏洞进行攻击。

未安装防火墙或配置不当：没有安装防火墙或者配置不当会增加服务器被黑的风险。

未禁用不必要的服务：未禁用不必要的服务或端口会增加服务器的攻击面。

未安装安全插件：未安装安全插件或者未对网站进行安全加固，容易被黑客攻击。

网站代码漏洞：网站代码存在漏洞，黑客可以通过漏洞进行攻击。

共享服务器：VPS服务器共享资源，如果其他用户的服务器被黑，也会对自己的服务器造成影响。

综上所述，保护VPS服务器安全需要用户采取多种措施，包括使用强密码、定期更新系统和软件、安装防火墙和安全插件等。