美国独立虚拟主机的运行效率受以下因素影响：

服务器性能：虚拟主机运行在物理服务器上，因此服务器的处理器性能、内存容量、硬盘速度等硬件参数会直接影响虚拟主机的运行效率。

网络带宽：虚拟主机的网络带宽决定了用户访问网站的速度，如果网络带宽不足，可能会导致网站加载速度缓慢。

资源分配：虚拟主机是通过资源虚拟化技术实现的，服务器上的资源会被分配给不同的虚拟主机使用，如果资源分配不均匀或者资源不足，可能会影响虚拟主机的运行效率。

软件配置：虚拟主机上的操作系统、Web服务器、数据库等软件的配置也会影响虚拟主机的运行效率，合理配置软件可以提高虚拟主机的性能。

系统负载：如果服务器上运行的虚拟主机过多，可能会造成系统负载过高，从而影响虚拟主机的运行效率。因此，合理控制服务器上的虚拟主机数量也是提高运行效率的重要因素。