MySql innodb如果是共享表空间，ibdata1文件越来越大，达到了30多个G，对一些没用的表进行清空：
truncate table xxx;
然后optimize table xxx; 没有效果
因为对共享表空间不起作用。
mysql ibdata1存放数据，索引等，是MYSQL的最主要的数据。

如果不把数据分开存放的话，这个文件的大小很容易就上了G，甚至几十G。对于某些应用来说，并不是太合适。因此要把此文件缩小。
无法自动收缩，必须数据导出，删除ibdata1，然后数据导入，比较麻烦，因此需要改为每个表单独的文件。

解决方法：数据文件单独存放(共享表空间如何改为每个表独立的表空间文件)。
步骤如下：

1）备份数据库

从命令行进入MySQL Server 5.0\bin
备份全部数据库，执行命令
D:\>mysqldump -q -umysql -ppassword --add-drop-table --all-databases > c:/all.sql

做完此步后，停止数据库服务。

2）找到my.ini或my.cnf文件
linux下执行 ./mysqld --verbose --help | grep -A 1 'Default options'
会有类似显示：
Default options are read from the following files in the given order:
/etc/my.cnf ~/.my.cnf /usr/local/service/mysql3306/etc/my.cnf

windows环境下可以：
mysqld --verbose --help > mysqlhelp.txt
notepad mysqlhelp.txt
在里面查找Default options，可以看到查找my.ini的顺序，以找到真实目录

3）修改mysql配置文件
打开my.ini或my.cnf文件
[mysqld]下增加下面配置
innodb_file_per_table=1

验证配置是否生效，可以重启mysql后,执行
show variables like '%per_table%'
看看innodb_file_per_table变量是否为ON

4）删除原数据文件

删除原来的ibdata1文件及日志文件ib_logfile*，删除data目录下的应用数据库文件夹(mysql文件夹不要删)

5）还原数据库

启动数据库服务

从命令行进入MySQL Server 5.0\bin
还原全部数据库，执行命令mysql -uusername -pyourpassword < c:/all.sql

经过以上几步后，可以看到新的ibdata1文件就只有几十M了，数据及索引都变成了针对单个表的小ibd文件了，它们在相应数据库的文件夹下面。