MySQL 5.5.3版本中引入了Metadata lock: DDL语句打破了事务的隔离级别
在5.5.3版本之前,MySQL事务对于表结构元数据(Metadata)的锁定是语句(statement)粒度的，即语句执行完成后，不管事务是否可以完成，其表结构就可以被其他会话更新掉！
引入Metadata lock后，表结构元数据(Metadata)的锁定变成了事务(transaction)粒度的，即只有事务结束时才会释放Metadata lock。

现象：
显式开启事务后start transaction; 该事务内的query语句(包含select)会占用相关表的metadata lock(profile:Opening tables阶段)
导致DDL语句被阻塞，因为获取不到表的metadata lock

MySQL 5.6.6版本后 优化
metadata lock不阻塞DDL语句，但原有session再访问此表时会返回Error信息“Table definition has changed, please retry transaction”

案列

session1mysql> start transaction;
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)


mysql> select * from test1 where id=1;
+------+------+
| id| name |
+------+------+
|1 | 1|
+------+------+
1 row in set (0.00 sec)

session2

mysql> set profiling=on;
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)
mysql> alter table test1 add column c2 int;---堵塞
mysql> show full processlist;
+----+------+-----------+------+---------+------+---------------------------------+-------------------------------------+
| Id | User | Host | db| Command | Time | State| Info|
+----+------+-----------+------+---------+------+---------------------------------+-------------------------------------+
| 4 | root | localhost | test | Sleep|10 | | NULL|
| 5 | root | localhost | test | Query|6 | Waiting for table metadata lock | alter table test1 add column c2 int |
| 6 | root | localhost | NULL | Query|0 | NULL| show full processlist|
+----+------+-----------+------+---------+------+---------------------------------+-------------------------------------+

我们可以看到ALTER TABLE会应Metadata lock而阻塞。一旦Session 1中的事务提交或者回滚，即释放了table1表的Metadata lock，Session2的操作立即可以执行
ctrl+c掉后我们查看profile执行计划

mysql> show profile for query 6;
+----------------------+----------+
| Status| Duration |
+----------------------+----------+
| starting | 0.000045 |
| checking permissions | 0.000005 |
| checking permissions | 0.000005 |
| init | 0.000007 |
| Opening tables| 0.000061 |
| System lock | 0.000008 |
| setup| 0.000018 |
| creating table| 0.002776 |
| After create | 0.000063 |
| copy to tmp table| 0.000312 |
| rename result table | 1.459601 |
| query end| 0.000031 |
| closing tables| 0.000285 |
| freeing items| 0.002271 |
| cleaning up | 0.000073 |
+----------------------+----------+
15 rows in set (0.00 sec)



可以看到，卡住的那一步是在rename result table，MySQL后台将ALTER保存变成连续操作“创建临时新表->插入老表的数据->临时新表取到老表(RENAME)”，即实际的变化老表的操作在RENAME阶段才发生。而这一步即是被阻塞的那一步。所以可以确认，Metadata lock影响到的是要真实修改表结构的动作。（回想：和pt-osc那节，一个select未执行完，alter 修改表结构产生metadata lock一个道理）

基于此，我们可以验证ALTER TABLE,RENAME TABLE,DROP TABLE都会被Metadata lock影响，验证步骤与上类似，省略。

值得注意的是，创建一个已存在的表也会被Metadata lock影响。如果在一个事务中用到了表A的Metadata lock（如SELECT了该表）且事务未完成，那么创建同名的表也会被卡住。所参考的文章中提及这一点。有兴趣可参看：讨论页 ，这里不作讨论。

metadata lock的另一个副作用：如上例中，ALTER TABLE应metadata lock被阻塞后，这导致后续其他事务针对该表的SELECT也会被阻塞！即ALTER TABLE的操作会影响到其他SELECT操作。根据上述示例：

Session2 mysql> alter table table1 add column c1 int;

此步一直处于等待状态时，新会话中查询table1。

Session3 mysql> select * from test1;#一直等待

Session4 mysql>show full processlist;
mysql> show full processlist;
+----+------+-----------+------+---------+------+---------------------------------+-------------------------------------+
| Id | User | Host | db| Command | Time | State| Info|
+----+------+-----------+------+---------+------+---------------------------------+-------------------------------------+
| 4 | root | localhost | test | Sleep| 1857 | | NULL|
| 5 | root | localhost | test | Query| 504 | Waiting for table metadata lock | select * from test1 |
| 6 | root | localhost | NULL | Query|0 | NULL| show full processlist|
| 8 | root | localhost | test | Query| 511 | Waiting for table metadata lock | alter table test1 add column c2 int |
+----+------+-----------+------+---------+------+---------------------------------+-------------------------------------+


Session1 mysql> commit;

第一个会话提交后，Session2、Session3也成功执行。看看Session3的select在哪个步骤需要等待：

Session3 mysql> show profile;
+——————————–+———–+
| Status | Duration |
+——————————–+———–+
| starting | 0.000018 |
| Waiting for query cache lock | 0.000003 |
| checking query cache for query | 0.000037 |
| checking permissions | 0.000007 |
| Opening tables | 22.502591 |
| System lock | 0.000013 |
| Waiting for query cache lock | 0.000024 |
| init | 0.000022 |
| optimizing | 0.000009 |
| statistics | 0.000011 |
| preparing | 0.000015 |
| executing | 0.000003 |
| Sending data | 0.000036 |
| end | 0.000009 |
| query end | 0.000005 |
| closing tables | 0.000006 |
| freeing items | 0.000007 |
| Waiting for query cache lock | 0.000003 |
| freeing items | 0.000015 |
| Waiting for query cache lock | 0.000002 |
| freeing items | 0.000002 |
| storing result in query cache | 0.000004 |
| logging slow query | 0.000002 |
| logging slow query | 0.000028 |
| cleaning up | 0.000003 |
+——————————–+———–+


可以看到SELECT语句首先检查查询缓存，没有命中，然后在Opening tables阶段卡住。

这引出了另一个特点，基于上述场景，如果后续的SELECT能够在查询缓存中命中，那么不会被ALTER TABLE卡住，因为不需要Opening tables操作。命中缓存SELECT的SHOW PROFILE如下：

mysql> show profile;
+——————————–+———-+
| Status | Duration |
+——————————–+———-+
| starting | 0.000017 |
| Waiting for query cache lock | 0.000004 |
| checking query cache for query | 0.000006 |
| checking privileges on cached | 0.000004 |
| checking permissions | 0.000007 |
| sending cached result to clien | 0.000011 |
| logging slow query | 0.000002 |
| cleaning up | 0.000003 |
+——————————–+———-+
8 rows in set (0.00 sec)

遗留问题1.为什么第二次查询，记录没有发生变化，但结果集返回空？

这个问题在这个页面进行了讨论，确认原因是：

MySQL中ALTER操作实际后台是“创建新表”->”拷贝老表数据”->”RENAME新表成老表”。InnoDB引擎针对客户端的REPEATABLE READ隔离级别，采用的是基于多版本(Multi-version)功能的”一致性读”，即在事务中第一个查询时，获取的是当时版本的表的快照，而ALTER操作后实际是创建的新表，这个新表对于之前的快照而言是没有数据的，所以第二次查询新表基于快照的数据，返回空。在MySQL 5.6.6版本后，这样的第二个查询会返回Error信息“Table definition has changed, please retry transaction”。详细请看这里。

遗留问题2.为什么没有锁等待超时？？

我们知道InnoDB行锁的等待时间超过innodb_lock_wait_timeout就会报超时错误。这里的metadata lock一直等待着，为什么没有超时呢？其实metadata lock的超时设置是另一个系统变量lock_wait_timeout。

lock_wait_timeout控制着所有涉及到metadata lock的操作，包括DML and DDL，以及在表、视图、存储过程、存储函数上的操作，以及LOCK TABLES、FLUSH TABLES WITH READ LOCK、HANDLER等。

lock_wait_timeout的默认设置时一年，可以动态设置，根据实际场景进行调整。

大量参考：
http://www.mysqlperformanceblog.com/2013/02/01/implications-of-metadata-locking-changes-in-mysql-5-5/