要在Navicat中加密备份文件，可以按照以下步骤操作：

打开Navicat软件，并连接到需要备份的数据库。

在Navicat的菜单栏中选择“备份”选项。

在备份设置对话框中，选择要备份的数据库对象，并设置备份文件的保存路径和文件名。

在备份设置对话框中，勾选“加密备份文件”选项，并设置加密密码。

点击“开始”按钮，Navicat将开始备份数据库，并将备份文件加密保存。

通过以上步骤，您可以在Navicat中加密备份文件，保护数据库数据的安全性。