在C语言中选择加密算法时，可以考虑以下因素：

加密强度：选择一个具有足够强度的加密算法，确保数据的安全性。执行效率：选择一个执行效率高的加密算法，避免影响程序的性能。开发难度：选择一个易于实现和使用的加密算法，减少开发成本和时间。标准化：选择一个被广泛认可和使用的加密算法，确保兼容性和可靠性。

常用的加密算法包括AES、DES、RSA等，可以根据具体需求和情况选择合适的加密算法进行字符加密。