在C语言中加密字符时，常见的问题包括以下几点：

加密算法选择不当：选择不安全的加密算法或者不合适的加密算法可能导致加密效果不佳，容易被破解。

密钥管理不当：密钥的生成、存储和传递是加密过程中非常重要的一环，如果密钥管理不当，可能导致密钥泄露，从而影响加密的安全性。

内存管理问题：在进行字符加密时，需要使用临时变量或者数组来保存加密结果，如果内存管理不当可能导致内存泄露或者缓冲区溢出等问题。

加密过程中数据丢失：在加密字符过程中，如果不小心丢失了加密后的数据，可能会导致无法解密或者数据损坏的问题。

加密效率问题：某些加密算法可能会消耗大量的计算资源和时间，在对大量字符进行加密时可能会影响程序的性能。

要避免以上问题，可以选择合适的加密算法、加强密钥管理、合理管理内存以及确保数据的完整性和安全性。此外，也可以考虑使用已经成熟的加密库或者框架来简化加密过程，提高安全性。