可以扫描网站安全漏洞的软件有：

1. Nikto这是一个开源的Web服务器扫描程序，它可以对Web服务器进行全面的测试，其扫描项目和插件经常更新并且可以自动更新。

2.Paros proxy这是一个对Web应用程序的漏洞进行评估的代理程序，基于Java的web代理程序，可以评估Web应用程序的漏洞。

3.WebScarab可以分析使用HTTP和HTTPS协议进行通信的应用程序，它可以用最简单地形式记录它观察的会话，并允许操作人员以各种方式观查会话。

4.WebInspect这是一款强大的Web应用程序扫描程序，它有助于确认Web应用中已知的和未知的漏洞，还可以检查一个Web服务器是否正确配置。

5.OWASP ZAP，它是一款易于使用，能够帮助用户从网页应用程序中寻找漏洞的综合类渗透测试工具。