在Linux中，删除运行中的进程文件可能会导致进程崩溃或数据丢失，因此不建议这样做。如果你仍然坚持删除运行中的进程文件，可以按照以下步骤操作：

首先确定进程的PID（进程ID），可以使用如下命令查看：

ps aux | grep <进程名>

然后使用kill命令结束该进程：

kill -9 <PID>

最后，再使用rm命令删除进程文件：

rm <进程文件路径>

请注意，删除运行中的进程文件可能会导致系统不稳定或进程数据丢失，谨慎操作。