要在Linux中使用Quota系统限制用户磁盘使用量，首先需要确保已经启用了磁盘配额功能。以下是设置用户磁盘配额的步骤：

挂载文件系统时启用磁盘配额功能：在/etc/fstab文件中为要启用磁盘配额功能的文件系统添加"usrquota"或"groupquota"选项，示例如下：

/dev/sda1 /home ext4 defaults,usrquota 0 2

之后重新挂载该文件系统：

mount -o remount /home

初始化磁盘配额数据库：使用命令quotacheck初始化磁盘配额数据库，示例如下：

quotacheck -cug /home

启用磁盘配额：使用命令quotaon启用磁盘配额，示例如下：

quotaon /home

设置用户磁盘配额限制：使用命令edquota来编辑用户的磁盘配额限制，示例如下：

edquota -u username

在编辑界面中设置用户的磁盘配额限制。

查看配额使用情况：使用命令repquota来查看配额使用情况，示例如下：

repquota /home

通过以上步骤，您可以成功地在Linux系统中使用Quota系统限制用户磁盘使用量。