要对Linux数据库系统的性能进行基准测试，可以按照以下步骤进行：

确定测试目标：首先要明确测试的目的和目标，比如测试系统的读写性能、并发处理能力、稳定性等方面。

选择合适的工具：根据测试目标选择合适的性能测试工具，常用的工具包括sysbench、pgbench、dbt2等。

准备测试环境：搭建一个与生产环境类似的测试环境，包括硬件配置、操作系统版本、数据库版本等。

设计测试方案：根据测试目标设计测试方案，包括测试用例、测试数据、测试参数等。

运行测试：按照设计的测试方案运行性能测试，记录测试结果。

分析测试结果：对测试结果进行分析，评估系统的性能表现，找出性能瓶颈并进行优化。

优化测试：根据分析结果对系统进行优化，再次进行性能测试，直至达到满意的性能表现。

通过以上步骤，可以对Linux数据库系统的性能进行有效的基准测试，并为系统的优化提供参考依据。