在Linux系统中，可以使用cp命令来拷贝整个文件夹。拷贝整个文件夹的命令格式为：

cp -r source_folder destination_folder

其中，-r表示递归地拷贝整个文件夹及其子文件夹和文件。source_folder为要拷贝的源文件夹路径，destination_folder为目标文件夹路径，即拷贝后的文件夹。例如，要将/home/user/source_folder拷贝到/home/user/destination_folder，可以使用以下命令：

cp -r /home/user/source_folder /home/user/destination_folder

请确保目标文件夹不存在或者不包含同名文件夹，以避免发生冲突或覆盖现有文件。