要在Linux系统中修改文件的字符集编码，可以使用iconv工具来实现。iconv是一个用于转换不同字符集编码的命令行工具，可以将文件从一种字符集编码转换为另一种字符集编码。

以下是使用iconv修改文件字符集编码的步骤：

首先，使用iconv命令将文件从当前字符集编码转换为目标字符集编码。例如，将一个UTF-8编码的文件转换为GBK编码的文件，可以使用以下命令：

iconv -f UTF-8 -t GBK input.txt > output.txt

上面的命令中，“-f UTF-8”表示输入文件的字符集编码为UTF-8，“-t GBK”表示输出文件的字符集编码为GBK，“input.txt”是要转换的输入文件，“output.txt”是转换后的输出文件。

如果要在原文件上直接修改字符集编码而不生成新文件，可以通过重定向方式实现：

iconv -f UTF-8 -t GBK input.txt > temp.txt && mv temp.txt input.txt

如果要批量转换多个文件的字符集编码，可以使用通配符来指定文件名：

for file in *.txt; do iconv -f UTF-8 -t GBK "$file" > temp.txt && mv temp.txt "$file"; done

通过以上步骤，就可以在Linux系统中使用iconv工具修改文件的字符集编码。请注意在转换字符集编码时，应根据实际情况选择适合的字符集编码。