要彻底删除文件，可以按照以下步骤操作：

在Eclipse中找到要删除的文件，右键单击该文件并选择“删除”。在删除确认对话框中，选择“将文件移至回收站”。打开回收站，找到被删除的文件并将其永久删除。可以使用一些文件恢复工具来确保文件已被彻底删除，例如Recuva、EaseUS Data Recovery Wizard等。

请注意，在删除文件后，建议清空回收站以确保文件不会被他人恢复。