在Debian系统上配置Filebeat时，可以采取以下安全措施：

使用TLS/SSL加密：为了确保日志数据在传输过程中的安全，Filebeat支持使用TLS/SSL加密。你需要生成SSL证书和密钥，并在Filebeat的配置文件中指定它们的位置以及目标服务器的地址和端口。

配置文件权限：确保Filebeat的配置文件（通常位于 /etc/filebeat/filebeat.yml）的权限设置正确，以防止未经授权的访问。可以使用 chmod 命令来设置适当的权限。

禁用不必要的模块和功能：在Filebeat的配置文件中，可以禁用不必要的模块和功能，以减少潜在的安全风险。例如，可以禁用索引生命周期管理（ILM）如果不需要使用。

使用安全的认证机制：如果Filebeat配置为将日志发送到Elasticsearch，可以使用Elasticsearch的x-pack安全功能，包括用户认证和角色管理，以确保只有授权的用户才能访问日志数据。

最小化权限原则：在运行Filebeat时，尽量使用具有最小必要权限的用户账户，以减少潜在的安全漏洞。

定期更新和监控：保持Filebeat及其依赖项的最新状态，并定期监控Filebeat的日志文件，以便及时发现任何异常活动。

网络隔离：将Filebeat部署在隔离的网络环境中，例如使用Docker容器或特定的网络命名空间，以限制其对其他网络部分的访问。

使用安全配置文件路径：确保Filebeat不会暴露敏感信息，例如通过配置 fields_under_root: true 来避免在根目录下存储敏感字段。

监控和警报：设置监控和警报系统，以便在检测到可疑活动时及时收到通知。

定期审计配置：定期审查Filebeat的配置和安全设置，确保它们符合最新的安全最佳实践。

通过实施这些安全措施，可以显著提高Filebeat在Debian系统下的安全性，防止潜在的安全威胁和攻击。