在CentOS系统中，反汇编指令通常是通过使用objdump、gdb或其他逆向工程工具来实现的。这些工具在反汇编过程中可能会遇到一些限制，主要包括以下几点：

权限问题：反汇编某些程序可能需要管理员权限，因为它们可能受到操作系统的保护。在这种情况下，你需要使用sudo命令来提升权限。

二进制文件格式：不同的二进制文件格式（如ELF、PE、Mach-O等）可能需要使用不同的工具或参数来进行反汇编。确保你使用的工具支持你要分析的二进制文件格式。

代码混淆：恶意软件或保护机制可能会对代码进行混淆，使得反汇编变得更加困难。在这种情况下，你可能需要使用更高级的逆向工程技术来分析和理解代码。

缺少符号信息：如果二进制文件没有包含调试符号，那么反汇编后的代码可能难以阅读和理解。在这种情况下，你可以尝试使用其他工具（如addr2line）来将地址转换为源代码行号。

架构差异：如果你在一个架构上反汇编另一个架构的二进制文件，可能会遇到兼容性问题。确保你使用的工具支持目标架构。

性能问题：对于大型程序，反汇编过程可能会非常耗时。在这种情况下，你可以考虑使用更高效的工具或方法，或者只针对特定的函数或模块进行分析。

法律和道德问题：在进行逆向工程时，请确保遵守相关法律法规和道德规范。未经授权的反汇编和分析可能会导致法律责任。