在Linux中，可以使用nohup命令来在后台运行程序，并指定输出文件。

要使用nohup命令指定输出文件，可以使用以下命令：

nohup command > output.txt &

其中，command是要在后台运行的命令，output.txt是要将输出内容存储到的文件名。

示例：

nohup python script.py > output.txt &

这个命令会在后台运行一个Python脚本，并将输出内容存储到output.txt文件中。