在FreeBSD中，可以使用以下命令来管理文件和目录的权限：

chmod：用于更改文件或目录的权限。可以使用数字或符号来指定权限。例如，要将文件设置为只读权限：chmod 400 file.txt

chown：用于更改文件或目录的所有者。例如，将文件所有者更改为用户user1：chown user1 file.txt

chgrp：用于更改文件或目录的所属组。例如，将文件的所属组更改为组group1：chgrp group1 file.txt

ls：用于查看文件或目录的权限。可以使用ls -l命令查看详细的权限信息。

umask：用于设置新建文件或目录的默认权限。可以使用umask命令查看或更改默认权限。